По мотивам http://www.mariobadr.com/using-clang-tidy-with-cmake-36.html

Другой вариант:

1. Создать compile_commands.json

   cd yaml-cpp_test\cmakefiles_gcc
   cmake -G "MinGW Makefiles" -DCMAKE_EXPORT_COMPILE_COMMANDS=ON ..
   

2. Открыть compile_commands.json
3. Открыть файл includes_CXX.rsp, указанный в строке command файла compile_commands.json
4. Заменить в файле compile_commands.json путь до файла includes_CXX.rsp на содержимое файла includes_CXX.rsp
5. Вызвать скрипт run-clang-tidy.py

   "D:\Program Files\LLVM\share\clang\run-clang-tidy.py" -p .
   

6. PROFIT