고려대학교 인간유전체 연구실 (안준용, 이혜지)
Update: 2022/01/23
Hail을 이용한 전장유전체 데이터 분석 튜토리얼에 오신 여러분을 환영합니다.
본 튜토리얼을 구동하기 위해선, 최소 쿼드코어 CPU와 8Gb 메모리 이상의 컴퓨터가 필요합니다. 튜토리얼에 사용하는 데이터는 맨 아래 섹션인 Appendix에서 찾을수 있습니다. 튜토리얼의 데이터는 1000 Genome Project의 high coverage depth WGS VCF 중 염색체 22번 일부를 임의로 추출하였습니다.
Update: 2022/10/20
튜토리얼 구글 코랩 버젼 링크. 참고, Hail은 GPU/TPU를 사용하지 않기 때문에 하드웨어 가속 없이 구동하면 됩니다. 또한 Hail은 일반적으로 CPU 노드 숫자가 중요하기에 코랩은 일반 HPC나 클라우드 환경보다 느립니다. 연습용 코드이니, 실제 구동환경에서는 이보다 빠르게 진행됨을 알려드립니다.