Taiwan Health MCP Server

台灣醫療健康資料整合 MCP 伺服器 整合 ICD-10-CM/PCS、SNOMED CT、LOINC、台灣 FDA 藥品 / 健康補充品 / 食品營養、臨床指引，以及 FHIR R4 IG 授權與驗證工具

以官方 TypeScript MCP SDK（@modelcontextprotocol/sdk）建構的 Node.js 伺服器，對外提供 51 個工具，涵蓋 12 個工具群組。專為高吞吐量的生產級 SaaS 部署設計。

後端執行環境：整個後端（MCP server、管理後台 REST API、背景 worker、所有資料載入器）皆為 Node.js / TypeScript，程式碼位於 node-server/。前端（公開頁面與管理後台 SPA）為 Next.js，位於 web/。本專案已無 Python 執行期相依。

專案特色

• 台灣在地化資料：台灣 FDA 藥品（含仿單 / 外觀 / OCR + LLM 分析）、健康補充品、食品營養、臨床指引、TWCore IG。
• 國際術語支援：ICD-10-CM/PCS 2025、SNOMED CT International、LOINC 2.80、FHIR R4。
• FHIR IG 授權工具：多 IG（package-scoped）剖面 / ValueSet 查詢、術語驗證、骨架填值（skeleton-fill）資源產生與驗證。
• 語意 / 混合搜尋：以嵌入模型（預設 Ollama qwen3-embedding）為基礎，無嵌入時自動退回關鍵字搜尋。
• 動態工具啟用：依各模組資料載入狀態自動註冊 / 移除可用 MCP 工具。
• 管理後台：可選的 Admin Console（上傳來源檔、執行 / 排程匯入、管理設定與外部 FHIR 伺服器、即時監控背景工作）。
• 生產部署設計：PostgreSQL 16（pgvector）、pgBouncer、Redis、MinIO、Prometheus、背景 worker，前置 nginx 單一入口。

工具顯示為 available 只代表來源資料已載入，不代表 embedding 已完整。請在 Admin → Modules 檢查各模組的 Embeddings 計數；未完成時搜尋會退回或混用 keyword/BM25。

快速開始

git clone https://github.com/healthymind-tech/Taiwan-Health-MCP.git
cd Taiwan-Health-MCP
cp .env.example .env                          # 設定 POSTGRES_PASSWORD、ADMIN_* 等
docker compose up -d

docker compose up -d 會啟動：

服務	說明
nginx	單一對外入口，預設 :8080（WEB_PORT）
web	Next.js 前端：公開頁面 + /admin 管理後台 SPA
app	Node MCP 伺服器 + 管理後台 REST API（node dist/server.js；只在內部網路，不對主機開埠）
admin-worker	背景工作執行器（所有匯入與嵌入工作，node dist/admin/adminWorker.js）
postgres	PostgreSQL 16 + pgvector
pgbouncer	連線池（transaction mode）
redis	回應快取
minio + minio-init	藥品資產物件儲存

重要：app 容器不對主機開放 8000 埠，所有流量都必須經過 nginx。請一律使用 http://<host>:8080（或你設定的 WEB_PORT）。

程式碼變更後重新部署：

docker compose build app web && docker compose up -d --no-deps app web

載入資料（透過管理後台）

資料匯入由 Admin Console 觸發、交由 admin-worker 背景執行（無獨立的 CLI data-loader 容器）。

1. 在 .env 啟用管理後台：

   ADMIN_ENABLED=true
   ADMIN_USERNAME=admin
   # 產生密碼雜湊（Node；本專案已無 Python 相依）：
   #   node -e "console.log('sha256$' + require('crypto').createHash('sha256').update('change-me').digest('hex'))"
   # ⚠️ 在 .env 中，每個 $ 都要寫成 $$（Docker Compose 會把 $ 當變數展開，
   #    當雜湊值以字母開頭時會被靜默截斷）。Compose 會把 $$ 還原成單一 $。
   ADMIN_PASSWORD_HASH=sha256$$...
   ADMIN_SESSION_SECRET=change_this_admin_session_secret

   重新啟動後（docker compose up -d），於 http://<host>:8080/admin 登入。

2. 在 Modules 頁籤依模組匯入資料：

   • 需上傳來源檔（在 Sources / Modules 上傳後按匯入）：ICD-10-CM/PCS、LOINC、SNOMED CT、RxNorm、FHIR IG（package.tgz）。
   • 由 API 自動抓取（直接按匯入或設定排程）：藥品（TFDA，三階段：索引 → 爬取豐富 → OCR/LLM 分析）、健康補充品、食品營養。
   • 內建種子資料（直接執行）：臨床指引。

3. 嵌入（語意搜尋）為獨立的 *_embed 工作，可於各模組頁面執行。嵌入 / OCR / 分析 LLM 的端點在 Settings 頁籤設定（存於 admin.llm_profiles，不透過環境變數）。

匯入進度、步驟時間軸與即時日誌可在 Tasks 頁籤查看。詳見管理後台文件與背景工作與排程。

工具群組

群組	工具
ICD-10	search_medical_codes、infer_complications、get_nearby_codes、check_medical_conflict、browse_icd_category
藥品 / TFDA	search_drug、identify_unknown_pill、get_drug_details、get_drug_asset_links
檢驗 / LOINC	search_loinc、query_loinc、interpret_lab_result、batch_interpret_lab_results
臨床指引	search_clinical_guideline、query_guideline
SNOMED CT	search_snomed_concept、query_snomed_concept、get_snomed_relationships、query_snomed_mapping
FHIR Condition	query_fhir_condition、validate_fhir_condition
FHIR Medication	query_fhir_medication、validate_fhir_medication
FHIR IG（授權 / 驗證）	fhir_list_igs、fhir_get_ig、fhir_list_artifacts、fhir_search_artifacts、fhir_list_resource_profiles、fhir_rank_resource_profiles、fhir_get_profile、fhir_get_profile_elements、fhir_get_valueset、fhir_expand_valueset、fhir_lookup_code、fhir_validate_code、fhir_normalize_code、fhir_resolve_reference、fhir_build_bundle、fhir_validate_resource、fhir_validate_bundle、fhir_get_resource_skeleton、fhir_finalize_resource
健康補充品	search_health_supplements
食品營養	query_food_nutrition、query_food_ingredient、search_foods_by_nutrient、analyze_meal_nutrition
FHIR 伺服器	list_fhir_servers、get_fhir_server_status、crud_fhir_server
系統	health_check

模組相關工具會依資料載入狀態自動啟用 / 停用；FHIR 伺服器與系統工具則永遠註冊。

除 crud_fhir_server 外，所有工具皆為唯讀。crud_fhir_server 可對已由管理者登錄的外部 FHIR 伺服器執行寫入（create / update / patch / delete），且必須該伺服器的 allow-list 允許、呼叫端並帶入 confirm_write=true。

連接客戶端

兩種介面都經由 nginx 前門提供（預設 :8080）：

介面	端點	適用客戶端
MCP（streamable-http）	http://<host>:8080/mcp	原生 MCP 客戶端（Claude Desktop、Open WebUI v0.6.31+ 的 MCP 連線等）
OpenAPI bridge	GET http://<host>:8080/openapi.json、POST http://<host>:8080/tools/<工具名>	僅支援 OpenAPI 工具伺服器的客戶端（如 Open WebUI 的 External Tools / OpenAPI 類型）

/openapi.json 依「目前已啟用的工具」動態產生 OpenAPI 3.1 規格；每個工具對應 POST /tools/<工具名>，以 JSON body 當參數呼叫。客戶端只要填基底網址 http://<host>:8080，即會自動抓取 /openapi.json。

注意：這兩個介面目前皆未強制驗證（與既有設計一致）；對外開放時請在前面加反向代理或 token。

資料庫 Schema

audit | admin | icd | drug | health_supplements | food_nutrition | loinc | guideline | fhir（multi-IG）| snomed | rxnorm

完整定義見 db/schema.sql（PostgreSQL 容器首次啟動時自動套用），增量變更見 db/migrations/。

管理後台（選用）

預設停用。於 .env 設定 ADMIN_ENABLED=true 並提供 ADMIN_USERNAME / ADMIN_PASSWORD_HASH / ADMIN_SESSION_SECRET 後，可於 /admin 存取，用於上傳來源檔、執行與排程資料匯入、管理設定與外部 FHIR 伺服器，以及監控由 admin-worker 執行的背景工作。詳見 docs/admin/。

開發

# 後端（MCP + admin REST + worker）
cd node-server
npm install
npm run build          # tsc -> dist/
npm run typecheck      # tsc --noEmit
npm test               # node --test（node-server/src/**/*.test.ts）

# 前端（公開頁面 + 管理後台 SPA）
cd web
npm install
npm run build
npm run typecheck

詳見開發指南與測試指南。

文件

完整文件請見 docs/，線上版由 MkDocs 發佈於 GitHub Pages（設定見 mkdocs.yml）。

致謝

• 台灣衛生福利部、TFDA
• Regenstrief Institute（LOINC）
• SNOMED International
• National Library of Medicine（RxNorm / UMLS）
• HL7 International（FHIR）
• WHO