Skip to content

Conversation

@carlvillads
Copy link

Updates get_suv_constants in rhscripts/dcm.py.
SUV-bw should be calculated from the SeriesTime DICOM tag instead of the AcquisitionTime tag

  • Add time_tag parameter to get_suv_constants, allowing to choose between using Series Time ((0008,0031)) or Acquisition Time ((0008,0032)) for time calculations, if Acquisition Time is still preferred.
  • Updated dcmread with stop_before_pixels=True since pixel data is not needed for header information

@ChristianHinge
Copy link
Contributor

Personligt vil jeg foretrække at funktionen giver en error hvis SeriesTime ikke eksisterer, frem for at defaulte til AcquisitionTime. Jeg frygter at det kan skabe nogle silent errors. SeriesTime bør altid eksistere for PET.

@carlvillads
Copy link
Author

Personligt vil jeg foretrække at funktionen giver en error hvis SeriesTime ikke eksisterer, frem for at defaulte til AcquisitionTime. Jeg frygter at det kan skabe nogle silent errors. SeriesTime bør altid eksistere for PET.

Giver god mening – jeg får lige lavet en ny commit

@carlvillads
Copy link
Author

@ChristianHinge hvad siger du til denne ændring?

...
# Scan time
if time_tag == 'series':
    acq_time = ds[0x0008,0x0031].value  # Series time
elif time_tag == 'acquisition':
    acq_time = ds.AcquisitionTime
else:
    raise ValueError("'time_tag' must be 'series' or 'acquisition'")
...

Har også dobbelttjekket selve tagget (for en sikkerheds skyld), og det burde være det korrekte

Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment

Labels

None yet

Projects

None yet

Development

Successfully merging this pull request may close these issues.

3 participants