現状、メタノードの出力は、パラメータセットごとにidが振られ、<metanode_name>/<parameter_id>-<metanode_name>というファイル名で出力される。パラメータの組み合わせが多くなると、<metanode_name>以下に生成されるファイルが膨大になり、maf内の後のタスクや、生成結果を別のファイルで利用するときに不便が生じる時がある。
例えば、1000番ごとにディレクトリを分けるなど、1ディレクトリ内に含まれるファイル数に上限を設けるなどが解決策として考えられる。